普瑞基准如何成为药企的“新型研发火伴”？

经纶江左

近日，阿斯利康和第一三共协作开发的靶向HER2的抗体偶联药物T-DXd（Enhertu?，又称DS-8201）在海南博鳌乐城国内医疗游览后行区落地，用于医治HER2阳性的乳腺癌及胃癌患者。
从T-DXd与以后最无效的药物T-DM1（Kadcyla?）的“头对头”III期临床实验后果来看：T-DXd疗效明显优于T-DM1，在既往承受过曲妥珠单抗和紫杉烷医治的HER2阳性乳腺癌患者的医治中，可以将患者的疾病停顿或死亡危险升高72%。钻研者评价的中位无停顿生存时间（PFS）达到25.1个月，是承受T-DM1医治的对比对于组数据的3倍。
能够说，T-DXd根本“推翻”了以后Her 2阳性乳腺癌的医治现状，为Her 2阳性乳腺癌的医治计划树立了极高的竞争标杆，同时也给国际一样在开发靶向HER2新药的企业带来了更大压力。
在这样的状况下，竞争者的选择未几：要末硬桥硬马地做“头对头”试验，要末寻觅差别化竞争战略（寻觅新的临床定位，例如开发不同的顺应证），固然也有企业选择持续按目后方案实现临床实验，力图获批上市，将来商业化的问题，将来再说。
国际新锐的新药研发公司康宁杰瑞（HK：09966）选择经过翻新的生物标记物（biomarker）来完成差别化竞争。在多组学数据挖掘和研发战略提供商普瑞基准的帮忙下，康宁杰瑞发现了其在研药物KN026的翻新的疗效预测标记物——CDK十二与Her2的共扩增。 该种类是一种HER2双特同性抗体，针对转移性乳腺癌等顺应证。基于翻新生物标记物，该种类在临床定位上获取劣势，胜利的可能性进一步晋升。
新药研发呼叫“me-different”
近些年来，生物标记物曾经被公以为“以精准医疗为导向的新药研发”的首要根底，首要性日趋晋升。
按照FDA对在研新药的统计，带有生物标记物的种类的获批胜利率，明显高于没有标记物的种类。不只短少生物标记物的新药临床钻研失败率高，并且，已经遭受失败的药物，经过适合的生物标记物，从而完成“起死复生”的案例，也不足为奇。因此，康宁杰瑞和普瑞基准协作发现的翻新标记物，无疑加强了KN026在HER2阳性乳腺癌这一众所注目的赛道中的竞争力。
是不是寻觅适合的生物标记物，这个问题的面前，是翻新药企对研发战略的选择。对翻新药（而非“me too”）研发企业来讲，在已知靶点上挖掘不同的价值，即“me-different”，是以后最值得注重的战略。
选择全新靶点，开发“first in class”是新药开发者梦寐以求的指标，但这象征着没有任何参考，从作用机制、反作用、用药计划，直到疗效，所有都有待药企自行钻研、验证，危险极高，需求药企拥有极强的零碎研发才能。
“me-different”则是一种危险与翻新的均衡，针对已知成药可能性高的靶点（确保危险可控），经过差别化的临床开发战略，为在研药物找到最能发扬价值的临床定位（确保不堕入内卷），例如不同于FIC种类的顺应证、合用人群（基于biomarker）、医治计划（如经过联用计划，加强药效、增加毒反作用，或战胜耐药）。
“me different”与目前国际药企广泛选择的fast follow（疾速跟随）战略对比，才能要求较高。“跟随”当然象征着短时间的安妥，但关于药企来讲，也象征着在临床实验、审批、上市销售等多个环节的长时间压力，由于“跟随”必将会致使同质化竞争。这不只重大挥霍资源，也间接影响产品的商业化表示：带量推销与医保会谈已致使同质化种类的商业价值大幅降落。
就政策导向来讲，近些年来，无论中美，新药审批政策导向性日趋明晰：“跟随式研发”不受欢送，“寻觅差别化劣势”成为新药开发的症结点。
尤为是在中国，药企面临的产业环境的变动更大。跟着国际药品审评规范的不停降级，“以临床价值为导向”的趋向愈创造显，政策更为强调对新药的审批要以“目前最好医治计划”为对比对于。同时，中国药企的“跟随者时间窗”也迅速收窄。
“fast follow”承压，“me-different”战略的首要性凸显，这是同一个产业事情的两面。
普瑞基准CEO季序我博士指出，无论是“first in class”仍是“me-different”都需求零碎的转化医学才能。尤为要强调，“me-different”不是强行独树一帜，而是“感性决策”，利用零碎生物学的思绪，进行临床未知足需要（疾病）的机制钻研，从而确保较高的胜利率。这一做法使得针对同一靶点开发的药物可以找到相对于共同的临床定位，获取差别化劣势。这也合乎近些年来新药研发畛域提倡的理念：从“份子导向”走向“疾病导向”。
要做到这一点显然其实不容易，需求新药研发者零碎性地晋升对生命繁杂零碎的了解才能，更好地解析疾病（例如肿瘤）总体调控网络，从而在份子机制层面晋升对靶点、顺应症、生物标记物的评价和发现才能，进而更好地在各个研发阶段做出决策，包罗靶点评价和选择、顺应证选择和拓展、生物标记物发现、耐药机制钻研、联用计划探究、不良反映预测等，进而更大水平地规避研发失败的危险，并进步其产品的临床价值和商业价值。
“过来十年，以癌症基因图谱（TCGA）为代表的临床样本多组学，以DepMap为代表的功用组学，以人类细胞图谱（HCA）为代表的单细胞组学为了解疾病的实质和开发无效医治战略提供了丰硕的数据根底、零碎化的思绪和日益成熟的剖析技术。”普瑞基准联结开创人梁晗传授表现：“公司经过将最有价值的组学数据和最早进的人工智能算法相结合，为翻新药研发企业赋能，进而为中国新药研发和精准医疗理论提供弱小的推进力。”


“多组学+大数据挖掘”推进新药研发
经过零碎生物学特别是多组学数据剖析来晋升新药研发效力的设法由来已久，但受限于两个要素：适合的数据，以及适合的剖析工具。
季序我博士指出，跟着多组学技术（例如单细胞测序、表白谱剖析）发生的数据量疾速增长，以及深度学习、因果推断等AI算法的开展，两个要素已初步具备。
在数据资源方面：如前所述，过来十年，癌症基因图谱（TCGA）、DepMap人类细胞图谱（HCA）等钻研名目，为了解疾病的实质和开发无效医治战略提供了丰硕的多组学数据根底。
在数据剖析方面：一样在过来十年间，以深度学习为代表的ML算法疾速开展，基于海量数据的迭代学习，研发人员能建设相应的疾病常识图谱，从而厘清疾发病生机制，助力研发。
知足了“无数据”、“会剖析”的两个根本条件，基于零碎生物学的新药研发战略就有了可行性。如今，在这些要素的独特推进下，愈来愈多药企开始注重基于生物信息学和计算生物学的新药开发战略。罗氏制药便冲破性地延聘计算生物学畛域的大牛——Broad钻研所的Aviv Regev博士，负责基因泰克（Genentech）的研发担任人，也是罗氏的研发委员会中心成员。
Aviv Regev博士是人类细胞图谱（Human Cell Atlas，HCA）的次要担任人之一，该方案意在绘制图谱，形容不同类型的细胞的份子特点、地位等信息，进而了解它们的片面功用，了解指点它们流动的网络。Aviv Regev在基因泰克推广改革性的研发战略，建立涵盖高精度和高通量组学试验、计算与机器学习、医治办法（therapeutic modality）和生物学的综合平台，以晋升研发效力，驾驭产业性时机。其总体战略十分强调基于“组学数据挖掘”的新药研发范式。
季序我博士表现，经过组学数据挖掘晋升产业研发才能，也是普瑞基准最基本的理念。不同于“基于AI算法设计药物份子构造”的“惯例”AI制药公司，普瑞基准专一于对疾病份子机制的解析，并依托在机制了解上的劣势，找到更公道、胜利率更高的开发战略。基于这一点，普瑞基准无效助力了协作药企火伴研发效力的晋升，帮忙药企进步研发胜利率，升高研发本钱，无望从基本上扭转新药研发产业效力下滑的总体趋向。
作为后行者，普瑞基准从与药企协作的研发教训粗浅领会到，从多组学数据挖掘导向新药研发决策，存在诸多技术应战。为此，普瑞基准开发了面向新药研发的肿瘤多组学数据挖掘零碎AIBERT ?，该零碎包罗“试验+计算”两大平台。其中，计算平台整合了 PB级别的多组学数据资源，包罗数量可观且高品质的中国肿瘤患者数据，强调数据的残缺性、标准性和丰硕性；多组学试验平台则具有高通量的全基因组筛选、Crispr-cas9基因编纂、基于表型的药物筛选、基于转录组的药物筛选等技术才能，可以为计算平台提供高品质的组学数据输出，也能够对计算剖析后果进行验证。零碎剖析后果指向性高，在肿瘤新药研发决策反对方面劣势显著。


“目前有不少新药研发企业，自我定位是做出有寰球竞争力的翻新种类，这抉择了他们在研发方面的“品尝”。他们有更新的理念，对研发更深的了解，有勇气寻求更翻新、有竞争力的研发效果。普瑞基准十分骄傲为他们提供全力反对。”季序我博士说。
基于AIBERT?，普瑞基准可以反对药企在研管线在不同阶段的决策，特别是为药企提供差别化开发战略，譬如在研发初期需求的靶点发现和评价、顺应证选择，中期的生物标记物（疗效标记物、抗性标记物）钻研、基于标记物的临床计划设计，前期的顺应证拓展、耐药机制钻研、联用计划探究、不良反映预测（基于标记物）等等。
如今，普瑞基准作为翻新药企的“新型研发火伴”，已与包罗恒瑞医药、阿斯利康等大型企业，以及多家新锐研发型biotech公司达成策略协作，总数超过30家，为药企提供包罗研发决策反对在内的总体办事。目前，愈来愈多有志于开发翻新管线的药企选择与普瑞基准深度协作，高效地、深化地进行机制钻研，打造中国的“寰球新”药物。


从团队层面看，普瑞基准人材实力雄厚。公司开创人兼CEO季序我博士2001年开始踏入生物信息学畛域，2007年在北大获取生物信息学博士学位，是国际生物信息学畛域最先造就的博士之一，并在生命迷信畛域具备丰硕的投资和产业教训；联结开创人梁晗博士为美国MD安德森癌症核心计算生物学与生物信息学系讲席传授，AAAS Fellow，作为寰球最首要的肿瘤组学钻研名目之一TCGA（The Cancer Genome Atlas，“癌症基因组图谱”）的迷信领导者之一，在国内肿瘤多组学和生物信息学畛域享有名誉。而团队的研发担任人、医学担任人和首席迷信家等多位中心成员来自MD安德森癌症核心、Northwestern University、Johns Hopkins University、北大、中科院等国际外一流高校和钻研机构，在多组学、生物信息学、医学和AI算法方面拥有深挚的配景。