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原标题:同一种癌症,为何在不同人群中存在微小差别?
▲分裂中的癌细胞,来源:美国国立卫生钻研院
虽然2003年已实现了人类基因组测序(HGP),但在癌症钻研中,无关肿瘤中的谱系印记等问题仍悬而未决。非洲后嗣和欧洲后嗣所患的肝癌存在根底的、份子程度的差别?东亚人与印第安人患的乳腺癌在基因图谱上有区分吗?
由美国癌症钻研院癌症基因组剖析网络的钻研人员颁发了一篇新论文,提供了目前最片面的血缘对正常或癌变组织份子组成的影响。钻研人员按照包孕10678名患者和33种癌症类型的癌症基因组图谱数据,发现血缘与数百个基因的变异无关,但一些最首要的变异产生在特定类型的组织中。这一钻研后果颁发在《癌细胞》杂志。
从份子的角度来看,非洲血缘的人往往与欧洲血缘的人所患的肾癌类型,其实不相反。在非洲血缘的人体内,较少泛起VHL基因的失活渐变,这一基因渐变会放慢肿瘤中的新血管成长。而与欧洲血缘的人比拟,东亚血缘的人患膀胱癌时,体内发生的免疫零碎反映更少。
在这项钻研里,钻研人员使用多种份子技术剖析不同血缘的患者的组织样本。患者被次要分红:欧洲人、非洲人、东亚人、南亚人、印第安人或拉丽人。此外,他们将最少拥有20%混合血缘的患者纳入混血种别(按照次要血缘被分为亚类,好比非洲混血,欧洲混血等)。全部钻研中,患者共有33种癌症类型,其中13种被进一步分为亚型。
经过癌症基因组图谱,他们对每个患者的组织进行了深化剖析,检测了癌细胞和正常细胞中的一系列份子特点。这些特点包罗基因渐变(DNA复制过错)、DNA甲基化模式(影响基因的表白)、信使RNA(DNA的转录模版)和microRNA(可协助或按捺基因的表白)。NCI癌症基因组剖析网络的钻研人员经过这些数据来视察,这些特点的差别是不是反应了血缘的差别。
Cherniack说:“咱们发现,和血缘相干的一切份子特点差别,存在于数百个不同的基因中。但是,后果标明,那些最明显的差别,即可以影响细胞的功用及其与其余身材部位的互相作用,拥有显著的组织特同性。”只管,在大少数类型的癌症中,血缘会影响到的份子特点,但不会同时影响多种癌症。例如,和非洲血缘相干的肺癌中的份子差别,其实不存在于乳腺癌、胰腺癌等癌症中。
这些数据也使钻研人员想问,当正常细胞演化成癌细胞是,它们携带的、和血缘相干的特性是不是被带进了癌细胞中。好比,欧洲血缘的人的肺细胞份子特点,是不是也能在他们的肺癌细胞中找到?
钻研人员发现,绝大少数状况都是这样。Beroukhim说,“在特定血缘的人身上,正常组织的大少数份子差别都会泛起在癌细胞中。”另外,有证据标明,其中一些份子差别可能会使具有类似配景的人,患上特定的癌症。
钻研人员表现,由混血患者提供的数据非常贵重。在初步剖析具有最少80%的5个谱系血缘的患者后,他们对来自混血人群的数据,进行相似的剖析。
钻研人员尚未肯定血缘间的份子差别,是由环境要素仍是遗传要素酿成的。但是,他们确实发现了血缘之间的遗传差别,这可解释在癌症中的许高发现。Beroukhim说:“咱们的钻研也指出,需求更多的血缘样原本发展一个更为片面的血缘剖析,尤为针关于正常组织。这项钻研也朝这一标的目的迈出首要的一步。”
编纂:李晨琰 |
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