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    自主研发全样本高通量单细胞全长测序技术,「M20 Genomics」无望推进单细胞测序进入临床运用

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    2022-9-1 18:21:43 47 0

    假如说基因测序技术能用来“读”DNA和RNA,单细胞测序则是在测序技术的根底上结合单细胞标志技术来完成“读”每一个个细胞,进而让人们充沛了解细胞命运调控及人类疾病,完成真实的“精准医疗”。2015年,美国10X Genomics公司推出寰球首款基于微流控平台的商业化单细胞测序技术,标记着人类对生命迷信的钻研进入了单细胞时期。
    业界以为,高通量单细胞测序技术无望逐步取代传统的高通量混池测序(bulk sequencing),尤为是在临床和药物开发方面代替或互补份子、细胞学和组织病理检测的现有技术,或用于新兴的免疫医治,细胞及基因医治等零碎性疗法的开发,拥有严重运用价值。伴有着产业化运用的潮流,不停有公司进入市场推进单细胞测序的国产化,典型有新格元生物、寻因生物、宸安生物、丹序生物、万乘生物等。
    36氪近期接触到的M20 Genomics(跃真生物)即是一家专一单细胞测序技术开发与产业运用的公司。不久前,M20 Genomics正式对外公布了寰球首个基于随机引物的全样本高通量单细胞全长测序技术 –“M20 Seq”,并同步公布了首个全样本高通量单细胞测序产品VITA系列(下列简称“VITA”)。


    VITA系列产品全景图
    据跃M20 Genomics联结开创人董灵引见,与现有的其余单细胞测序技术比拟,M20 Seq拥有全长转录组测序、全样本类型、高灵活度、跨平台兼容性、全物种、百万级超高通量等特征。
    “传统单细胞测序办法依赖于polyA捕捉,仅限于钻研mRNA的表白量,并拥有3’或5’偏好性,并且要求十分高的细胞活性;咱们的技术是基于随机引物结合的原理,获取的是全长信息,非但能够实现对白腊等组织类型的剖析,还能够对包罗mRNA以及非编码RNA在内的total RNA进行渐变和融会的剖析,失掉更片面的遗传信息。这将为钻研和检测癌症等基因渐变疾病带来全新的剖析技术和工具化产品。”
    据M20 Genomic公司官网显示,M20 Seq技术拥有下列六大劣势:
    全长转录组测序。基于随机引物原理可对RNA全出息行测序,进行基因渐变、基因融会、拷贝数变异、非编码RNA、可变剪接等检测,扩展单细胞测序技术在肿瘤临床检测方面的运用。
    全样本类型。不只可用于陈腐组织、冻存组织,还能够解决FFPE样本难以进行单细胞转录组测序的困难,使钻研再也不受限于样本类型、时间、间隔,更合适试验室核心化检测模式,进而拓展更大的市场空间。
    高灵活度。M20 Seq大幅度进步了单细胞测序的基因检出数。以陈腐组织、冻存组织和FFPE样本为例,单个细胞的中位基因检出数分别可达到5000、3500和2500,而且展示出微小的可优化后劲。
    跨平台兼容性。在液滴与微孔技术平台均能获取优异的检测成果。
    全物种。无论是细菌等原核生物细胞,仍是人类、植物、动物等真核生物细胞,均可以经过M20 Seq进行测序。
    超高通量。细胞捕捉数大幅进步,最高可达到百万级,是现有单细胞测序技术通量的百倍以上。
    从运用端整体来讲,基于M20 Seq办法的VITA除了能大幅度晋升单细胞测序技术的检测灵活度,也能拓宽单细胞技术的运用畛域
    董灵告知36氪,“目前单细胞测序还停留在科研办事或者临床钻研运用阶段,间隔真实的临床推行还有很长的路要走,其次要缘故如下:
    第一,受限于样本类型,必需活性高于80%的陈腐组织,而除了内科医生外,其余医生能够获取陈腐组织的可能性是十分小的。只管近期也泛起了能够做冻存组织的平台,然而其基因检出数远远不克不及达到临床要求;
    第二,现有单细胞转录组技术存在较大偏好性,测序数据集中在mRNA的3’或5’端,只能简略的进行表白量的剖析,而对临床最关注的渐变、融会、拷贝数变异的检测能干为力;
    第三,细胞通量仍然偏低,千级和万级的细胞量是很难片面反应组织的全貌的,检测的全面性就会致使临床判别的不许确;
    第四,本钱太高,单个样本的检测以及剖析动辄2,3万,这关于需求救治的患者来说,无疑是雪上加霜;
    第五,医疗运用畛域关于产质量量的不乱性要求是十分高的,需求少量的临床样本验证。
    “只要很好的解决了上述问题,咱们才有可能使单细胞测序真正进入临床运用。”董灵告知36氪,为此,M20 Genomics想要经过关于技术壁垒的不停冲破,除了完成对样本类型有限制、百万细胞超高通量捕捉、转录组全长剖析外,还要按照临床或制药的运用场景,完成指标基因的特定捕捉,从而大大升高测序本钱,让掩盖基因数或者位点数能够从几个掩盖到不计其数个。
    据悉,M20 Genomics将重点推进单细胞技术在肿瘤、生殖、苍老、感染和免疫等畛域的运用,其中肿瘤是公司目前重点发力的标的目的,“次要斟酌到市场容量大且现阶段市场教育相对于成熟,临床专家以及医生承受水平较好”。
    董灵表现,根据方案,此次“VITA”公布后,公司但愿在1年-1年半时间将产品在科研畛域打造更为不乱,并经过和更多临床医生发展科研课题协作,不停挖掘客户需要等,譬如钻研“渐变患者细胞是不是有信号通路的改动,以及对后续用药是不是有指点”等,辅佐相干产品开发和经营任务。不外她也指出,目前尚无到科研市场的发作节点,这有赖于行业玩家独特把技术做成熟,独特升高测序本钱
    在谈及行业壁垒时,董灵指出,单细胞测序在医疗行业运用的开展轨迹可能会和NGS行业相似,即初期存在一定技术门坎,次要比拼技术;后续技术壁垒可能缓缓丢失,开始有报证要求;而后则是比拼行业资源和办事质量等。但她也指出,与混池测序不同的是,单细胞测序行业壁垒较高,目前国际大少数公司都是利用polyA捕捉的原理,和10xGenomics类似,这是相对于对比容易完成的门路,而拥有冲破性技术和产品的公司百里挑一,M20 Genomics竞争力可继续存在。
    团队方面,本次受访的联结开创人&总裁董灵为北大临床医学博士,具有丰硕的相干医学畛域企业和经营办理教训;联结开创人团队中既有办事国内金融机构和产业团体,长于企业经营和投融资配景的成员;也有结业于海内顶尖高校且长时间从事单细胞测序技术的钻研和开发的成员,等等。 目前公司已达到50人的范围。
    地下材料显示,2022年终,M20 Genomics实现了由启明创投领投、巢生资本跟投的天使轮融资;2022年4月,其又宣告实现了由红杉中国领投、泰煜资本跟投的pre-A轮融资;2022年7月,再次实现由浙江大学启真医疗基金独家领投的pre-A+轮融资。

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